园区的建设和日常管理由湘西自治州水土保持生态环境监测分站负责，接受湘西自治州水利局领导，现场管理和观测人员实行聘任制，按照州水保监测分站的授权开展实验观测和生产组织等工作，生产工人主要在当地招聘季节性临时工；水保监测分站与吉首大学生物资源与环境科学学院长期合作开展观测和相关专题实验；为规范管理，相继制定了《园区建设管理办法》、《园区运行管理制度》等规章制度。目前园区内开展的水土保持监测工作经费主要来源于上级拨款和州本级水土保持补偿费，其它生产性项目基本能够实现“以园养园”。