2006年7月29日—8月7日，水利部、中国科学院、中国工程院、黄河水利委员会上中游管理局及新疆维吾尔自治区水利厅组成的中国水土流失与生态安全综合科学考察团对新疆风水蚀复合区进行了综合科学考察。在新疆有关部门和自治区各有关地（州）、县（市）、乡（镇）领导和专业人员的积极参与和支持下，在科学考察团全体人员的共同努力下，科学考察活动历时10天，行程近6000公里，新疆风水蚀复合区中国水土流失与生态安全综合科学考察活动取得圆满成功。

新疆风水蚀复合区科学考察活动采取内业收集资料、外业实地踏勘、听取汇报、召开座谈会的形式进行。科学考察团实地考察了新疆伊犁州的霍城县、伊宁市、察布查尔县、伊宁县、特克斯县、新源县和巴州的库尔勒市、和静县、博湖县、尉犁县、和硕县等县（市）。考察的内容既有山体滑坡、“三化”草场、水蚀沟、重力侵蚀以及河道侵蚀等水土流失严重地区，也有开都河源头、孔雀河源头、博斯腾湖周边生态环境、大小湖隔堤、扬水站、国道217线公路水保工程、以及伊宁市北山坡小流域治理区、伊宁县北山坡小流域治理区、特克斯县万亩生态林与草场退化治理、巴音布鲁克草场封育、库尔勒市城市水土保持治理区等正在进行和已完成的治理区。

野外实地考察结束后，召开了新疆风水蚀复合区中国水土流失与生态安全综合科学考察座谈会。考察团专家组与新疆的水土保持专家进行了充分的讨论和交流。并且针对新疆水土保持与可持续发展的关系、新疆水资源利用与水保生态的关系、保护与开发的关系等问题开展了讨论，并为新疆水土保持工作提出了很好的意见和建议。

中国水土流失与生态安全综合科学考察团专家组对新疆治理水土流失、保障生态安全所取得的成绩给予了充分肯定，认为在各级领导的重视下，以小流域水土流失综合治理和生态修复项目为试点和示范，极大地推动了的水土保持生态环境治理工作，取得了显著的生态效益、经济效益和社会效益。

专家组认为：新疆自然地理环境十分特殊，新疆水土保持具有独特性，新疆的水土流失面积占到了全国水土流失的三分之一，必须把新疆水土保持的内容纳入到中国水土流失与生态安全综合科学考察总报告中十分重要和必要。新疆的水土流失不得到根本的治理，全国的水土流失也就得不到根本的治理。

专家组建议：国家应尽快将新疆伊犁河流域和开都河流域的水土流失治理纳入国家重点治理计划之中，必须尽快启动新疆伊犁河流域水土流失治理应急工程，治理水土流失、保护国土，呵护绿洲生态。